定制合成 Custom synthesis
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肽的耐化学性取决于氨基酸的成分和序列。冻干肽通常比溶液中的对应物更持久。肽的潜在降解方法如下:
1、水解:这通常包含在序列中的Asp中(D)对于肽中的问题,它非常容易脱水形成环形酰亚胺中间体。例如,序列中有Asp。-Pro(DP)在这种情况下,酸催化产生的环形酰亚胺中间体会导致肽链的切割。类似地,序列中存在Asp-Gly(DG)在这种情况下,环形中间体可以水解成异天冬氨酸的原始Asp模式(无害)或潜在的非活性类似物。最后,所有天冬氨酸模式都可以完全转化为异天冬氨酸类似物。在较小的水平上,它含有Ser(S)这个序列还可以形成一个环形酰亚胺中间体,可以最终切割肽链。
2、脱酰胺:这种碱催化反应经常发生在含有Asn的情况下-Gly(NG)或Gln-Gly(QG)在序列中,并遵循类似的Asp-Gly(DG)序列机制。Asn-Gly序列中的脱氨基(胺丢失)产生环形酰亚胺中间体,然后水解产生Asn天冬氨酸或异天冬氨酸类似物。此外,环形酰亚胺中间体可以导致D-Asp或外部消旋转化为AsnD-iso-类似于Asp的东西,所有这些都可能是非活性的。
3、氧化:Cys和Met残留物是经历可逆氧化的主要残留物。半胱氨酸的氧化在更高的pH值下加速,其中硫醇更容易去除质子化,并且容易在链中或链间产生二硫键。使用二硫苏糖醇(DTT)或三(2-羧乙基膦)盐酸盐盐(TCEP)处理可以很容易地逆转二硫键。甲硫氨酸通过化学和光化学进行氧化,产生甲硫氨酸二氧化物,进一步进入甲硫氨酸二氧化物,两者都很难逆转。
4、二酮哌嗪和焦谷氨酸的产生:当二甲基哌嗪的形成通常发生在Gly位于N端的第三位时,尤其是如果Pro或Gly位于1或2位。这种反应涉及到N端氮的亲核攻击在第二氨基酸和第三氨基酸之间的酰胺苄基上,导致二酮哌嗪方法的前两个氨基酸被切割。另一方面,如果Gln位于N端,焦谷氨酸的形成几乎是不可避免的。这是一种类似的反应,其中N端氮攻击Gln的侧链基碳,形成焦谷氨酸肽类似物脱氨基。这种转换也发生在N端含有焦谷氨酸肽类似物。
5、外消旋化:这个术语广泛应用于指氨基酸或肽的手性完整性的整体损失。外消旋化涉及将碱催化对映异构体(通常为L型)的氨基酸转化为L型和D型对映异构体的1型。:1.混合物。在肽生成过程中,这一点比较重要,但成品肽中的问题较少。另外,这种转换很难被发现,也无法控制。
避免或最小化肽降解的一般方法是将肽降解到-20℃或更好-80℃以冷冻干燥的方式储存(如果有的话)。如果肽在水溶液中,应冷冻每个等分样品,以避免冻融。应避免暴露在pH>中 8.但是,如果需要pH>的话 8时融解肽,则应将其暴露最小。
写到最后:
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