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本文介绍两种基本氨基酸:甘氨酸(Gly)和丙氨酸(Ala)。这主要是因为它们可以作为打底氨基酸,给它们添加基团可以生成其他种类的氨基酸。
甘氨酸有一种特殊的甜味,所以它的英文名字来自希腊语glykys(甘甜)。甘氨酸的汉译不仅有“甜”的意思,而且发音相近,堪称“信、达、雅”的典范。由于甘氨酸的甜味,在食品工业中常被用作调味剂,以去除苦味,增加甜味。甘氨酸的侧链很小,只有一个氢原子。这让他与众不同。它是一种没有手性的碱性氨基酸。
甘氨酸在蛋白质中的特点是体积小、灵活。例如,胶原蛋白的三股螺旋构象就非常特殊。每两个残基必须有一个甘氨酸,否则会导致空间位阻过大。同样,一个蛋白质的两个结构域之间的连接通常需要甘氨酸提供构象灵活性。然而,如果甘氨酸足够灵活,其稳定性必然不足。
在α-螺旋的形成过程中,甘氨酸是扰流剂之一。原因是侧链太小,构象根本不能稳定。此外,甘氨酸常用于制备缓冲溶液。经常做电泳实验的人一定记得。
丙氨酸的英文名字来自德语乙醛,中文名字比较容易理解,因为丙氨酸含有三个碳,化学名称是氨基丙酸。这是一个简单的名字,就像氨基酸的特征一样。丙氨酸的侧链只有一个甲基,比甘氨酸略大。当我画出其他18种氨基酸的结构公式时,我给丙氨酸加基团。在蛋白质中,丙氨酸就像一块砖,是一种普通的基本建筑材料,与任何人都不冲突。
丙氨酸侧链位阻小,位于α-螺旋中,是一种构象;β-折叠时也非常稳定。在蛋白质工程中,如果想要突变蛋白质上没有特定靶点的某个氨基酸,一般可以将其突变为丙氨酸,不容易破坏蛋白质的整体构象。
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