在有机化学中，肽合成是肽的生产，肽是通过酰胺键（也称为肽键）连接多个氨基酸的化合物。肽通过所述的缩合反应化学合成的羧基一个氨基酸的氨基基团的另一种。通常需要保护基团策略以防止与各种氨基酸侧链发生不希望看到的副反应。最常见的化学肽合成方法是从肽的羧基末端（C末端）开始，然后向氨基末端（N末端）进行。生命有机体中的蛋白质生物合成（长肽）以相反的方向发生。

肽的化学合成可以使用经典的溶液相技术进行，尽管在大多数研究和开发环境中已被固相方法取代（见下文）。然而，溶液相合成在工业生产的肽的大规模生产中保留了其有用性。

化学合成促进了难以在细菌中表达的肽的产生，非天然氨基酸的掺入，肽/蛋白主链的修饰以及由D-氨基酸组成的D蛋白的合成。

      固相合成

在实验室中已建立的生产合成肽的方法被称为固相肽合成（SPPS）。由Robert Bruce Merrifield率先开发， SPPS可以通过氨基酸衍生物在不溶性多孔载体上的连续反应来快速组装肽链。

固体支持物由小的聚合树脂小珠组成，这些小珠被连接至新生肽链的反应性基团（例如胺或羟基）官能化。由于肽在整个合成过程中均保持与载体共价连接，因此可以通过洗涤和过滤除去过量的试剂和副产物。该方法避免了在每个反应步骤之后从溶液中相对耗时地分离产物肽，这在使用常规溶液相合成时将是必需的。

必须使用适当的保护基团（例如Boc（酸不稳定）或Fmoc（碱基不稳定））根据其侧链和氨基酸的不同，在肽段的N端和侧链上对每个要偶联的氨基酸进行保护。使用的保护策略（请参见下文）。

一般的SPPS程序是交替的N端脱保护和偶联反应的重复循环之一。可以在每个步骤之间洗涤树脂。首先，将氨基酸偶联至树脂。随后，将胺脱保护，然后与第二氨基酸的游离酸偶联。重复该循环，直到合成了所需的序列。SPPS循环还可以包括加帽步骤，以阻止未反应氨基酸的末端发生反应。在合成结束时，将粗肽从固体支持物上裂解下来，同时使用试剂强酸（如三氟乙酸或亲核试剂）除去所有保护基。可以从非极性溶剂（如乙醚）中沉淀出粗肽，以除去有机可溶副产物。可以使用反相HPLC纯化粗制肽。纯化过程，特别是较长肽的纯化过程可能具有挑战性，因为必须去除与产物非常相似的少量几种副产物。因此，在商业环境中越来越多地使用所谓的连续色谱法，例如MCSGP，以在不牺牲纯度的前提下最大化产量。

SPPS受反应产量的限制，通常70个氨基酸范围内的肽和蛋白质正在推动合成可及性的极限。综合难度也取决于序列；通常，容易产生易于聚集的序列，例如淀粉样蛋白。可以通过使用诸如天然化学连接之类的连接方法获得更长的长度，其中两个较短的完全脱保护的合成肽可以在溶液中连接在一起。

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